影響反滲透阻垢劑阻垢效果的因素很多，每個因素都有較大的變化范圍。藥劑濃度是影響效果的主要因素，反滲透阻垢劑的目的是防止結垢和膠體污染。在一般條件下，阻垢劑對不同使用條件阻垢分散效果都有著不同程度的影響。

一、鐵離子的影響：

在循環水中，常因金屬腐蝕使鐵離子濃度增加，特別是使用強腐蝕性水質的循環水系統和有物料泄漏系統，鐵離子濃度有時高達5mg/L。鐵離子對所有的藥劑的阻磷酸鈣垢均有巨大影響，隨鐵離子濃度增加，阻磷酸鈣垢的效果大幅度下降。

二、鈣硬和堿度的影響：

人們在反滲透阻垢劑處理實踐中發現，水中鈣硬和堿度對阻垢分散劑的效果影響巨大。隨鈣硬和堿度的增加，阻垢率下降,但影響程度是不相同的.

與阻碳酸鈣相比,水中鈣硬和堿度對阻碳酸鈣效果的影響更大。如除對藥劑阻磷酸鈣效果影響相對較小外這些藥劑對磷酸鈣幾乎完全失去阻垢作用。

 三、殺菌劑的影響：

藥劑自身濃度是影響阻垢分散效果的因素之一。對阻碳酸鈣的影響與阻磷酸鈣不同，對阻磷酸鈣存在規定低濃度，只有藥劑的濃度超過這個低濃度，藥劑才有阻磷酸鈣的作用。濁度對藥劑阻垢分散效果均有不同程度的影響，但對阻磷酸鈣的影響更大，隨濁度增加，阻磷酸鈣的效果大幅度下降。鐵離子對藥劑阻垢分散作用影響明顯，無論是對阻碳酸鈣還是阻磷酸鈣，都是隨鐵離子濃度的增加，阻垢分散效果下降。